血浆病原DNA提取试剂盒在操作简便性上具有一定优势,更适合于较多样本的检测。对纯度要求较高的实验,可根据实验需求进行选择。
血浆病原DNA提取试剂盒采用特别的裂解液配方,可直接从新鲜、冷冻或陈旧的全血中提取高质量的基因组DNA,也可以直接提取得到血液中感染的细胞DNA, 省去了一般血液DNA提取试剂盒所需的白细胞分离步骤,操作简便快速,只需几十分钟左右即可完成血液DNA提取,并且DNA提取得率较高,可在200 μl 全血中提取2-5ug左右基因组DNA。血浆病原DNA提取试剂盒采用了较新的优良离子膜、裂解液和洗脱液,经过多次优化,提取得到的DNA纯度更高,较大限度地去除了蛋白、色素、脂类等杂质污染,可以直接应用于PCR、荧光定量PCR和各种酶切试验等。
游离DNA提取方法一般有TRizol方法、离心柱法、磁珠法。其中,Trizol方法与离心柱相比,提取效果相当,但是因其对操作者带来的毒性,现在越来越被弃用。磁珠法比较适合机器自动化提取,如果没有核酸提取仪,只是使用磁力架配套提取,磁珠法的操作就比较麻烦且容易导致样本交叉污染。另外,根据研究,磁珠法的核酸提取得率不如离心柱法。如果要提取的游离核酸的量比较低,选择离心柱法。对于游离DNA含量较低的样本或比较珍贵的样本或样本总数不是很多的实验室,核酸提取方法应是离心柱法。
血浆病原DNA提取试剂盒有较高的提取得率。核酸提取得率的确定,常用的是使用紫外分光光度计的方法。但是,血清、血浆样本中游离核酸含量较低,如果直接用紫外法检测,得出的数值并不准确,而且多次测量的结果会变异很大。关于提取得率,1ml正常血浆样本cfDNA得为7.35ng左右,但如果白细胞大量凋亡,血浆中的游离DNA量会有所增加,病人血浆中的DNA会大幅增加。
血浆病原DNA提取试剂盒中时间成本、生产率的考虑:
当一次处理**过50个样本时,不再考虑使用小量柱纯化,高通量DNA提取试剂盒是更好的选择,它可以以96孔的形式运行,以便在需要同时处理多个样本的DNA的实验。
DNA提取试剂盒有各种规格和大小,然而,共同的主线是,所选择的试剂盒能产生干净和浓缩的DNA。可以定期评估DNA提取物的数量和质量,以确保试剂盒适合此应用类型。
一般来说,质粒DNA分离要比基因组DNA分离温和。这是因为针对质粒DNA的裂解步骤需要染色体DNA与细胞蛋白片段保持结合,以防止其污染终的样品。两种类型的DNA回收都有试剂盒,甚至有可以同时纯化基因组DNA和总RNA的试剂盒。
当使用血浆病原DNA提取试剂盒分离不同血液体积样本时,能表现得更好,在于提取更高的DNA产量和纯度。
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